GS-MS氣質聯用儀的填充柱氣相色譜的柱管通常為長1-3m，內徑2-3mm的不銹鋼管，為節省柱溫箱空間而將柱管彎成環狀。在管內壁涂漬液體物質（氣-液色譜）或在管內填充固體吸附劑（氣-固色譜）。而現在的算低熱質細管氣相色譜柱，它*額電阻直接加熱配合快速溫升控制使得質譜儀的檢測樣品汽化非暴力過程往往只需要幾秒鐘。
1. 氣-液色譜
原理： 各溶質在氣相（流動相）和液相（固定相）間分配系數不同達到分離。
固定相： 涂漬在惰性多孔固體基質（載體或擔體）上的液體物質，常稱固定液。使用過的氣-液色譜固定液上千種，常用的固定液有聚二甲基硅氧烷、聚乙二醇、含5％或20％苯基的聚甲基硅氧烷、含氰基和苯基的聚甲基硅氧烷、50％三氟丙基聚硅氧烷，另外，用于分離手性異構體的手性固定相則主要有手性氨基酸的衍生物、手性金屬配合物和環糊精衍生物。
常用的基質： 無機載體（如硅藻土、玻璃粉末或微球、金屬粉末或微球、金屬化合物）和有機載體（如聚四氟乙烯、聚乙烯、聚乙烯丙烯酸酯）。
2. 氣-固色譜
氣-固色譜的固定相是固體吸附劑，分離是基于樣品分子在固定相表面的吸附能力的差異而實現的。常用的固體吸附劑有碳質吸附劑（活性炭、石墨化碳黑、碳分子篩）、氧化鋁、硅膠、無機分子篩和高分子小球。
氣-固色譜不如氣-液色譜應用廣泛，主要用于氣體和低沸點烴類的分析，在石油化工領域應用很普遍。
